有机肥生产设备主要是发酵部分和生产造粒部分。有机肥原料即便是发酵比较好，造粒也比较困难，因为有机原料的特点是原料粗糙，较轻，粘结率比较低。不同的有机原料都有不同的特点，因此选设备时，应特别慎重，不然不但会影响产量，而且造出的产品外表也达不到要求。
生物有机肥生产线包含的主要设备:
1.自动配料系统：自动配料系统主要由给料系统、称重装置、料仓、输送皮带组成。并且静态配料系统同时具有动态配料的速度和普通静态配料的精度（0.2%）。
2.新型有机肥造粒机：它采用湿法连续推杆造粒设计制造。此机不但可对多种有机物进行造粒，对使用常规设备难以成粒的粗纤维物料。
3.卧式搅拌机：该系列卧式混合机是我公司研制的混合设备，该机混合度高，残留量少，适合于配合有机肥、无机肥的混合。
4.滚筒筛：该机采用了组合式筛网，便于维修与更换，其结构简单、操作方便、运转平稳，是复混肥生产中的理想设备。
5.输送机：适用于煤炭、冶金、矿山、化工、建材、码头、仓库、工地等输送散状物料或箱袋状物品，适合在化肥厂、水泥厂等需要人工装车的环境中使用，节省了大量人员。
6.烘干机：该机具有外形美观，操作简单、能耗低、寿命长、干燥均匀、维修方便等特点。
7.热风炉：热风炉锅炉采用回水引射等技术，解决了锅壳式锅炉的管板裂纹、锅筒下部鼓包、水冷壁爆管、热效率低、出力不足，煤种适应性差等问题。
8.包装秤：包装秤主要由自动定量包装秤（由储料斗、喂料器，称重夹袋斗，揉实机构，电脑控制，气动执行部分等构成）与选配部分（输送机、缝口机/热合机）组成。
设备的选择需注意的几大关键因素：
发酵的方式、何种有机原料、机械化程度，年产量。有机肥内在品质做得好坏主要看发酵部分及产品的配方。发酵部分的关键因素有：微生物、碳氮比、碳磷比，水分，PH值、曝气控制。如果一种因素控制不好就会产生不发酵，发酵不完全，或是发酵时间长的状况。有机无机复合肥产品配方和无机肥一样也要根据不同的土壤，不同的作物配方也有差别。如果发酵充分配方得当，效果比无机肥还好，造价低，并且做为绿色肥料，还能改良植物生存的环境和土壤的团粒化。
有机肥有养分含量高、副成分少且物理性状好等优点，这些优势对于提高肥料利用率，平衡施肥，促进作物的高产稳产有着关键性的作用。但它在不同土壤和不同作物所需的营养元素种类、数量和比例这样多样性的状况下，养分比例还总是保持一样。因此，使用前进行测土，了解田间土壤的质地和营养状况，另外也要注意同单元肥料配合施用，才能使其发挥效果。
